이종적인 생물정보학 자료간의 관계 표현을 위한 시각화 시스템
Visualization System for Relationship between Bio-data Types
- 발행기관 부산대학교
- 지도교수 이도훈
- 발행년 2010
- 학위수여년월 2010. 2
- 학위명 석사
- 학과 및 전공 대학원 컴퓨터공학과
- 논문 페이지 32
- 실제URI http://www.dcollection.net/handler/pusan/000000059063
- 본문언어 한국어
- 저작권 부산대학교 논문은 저작권에 의해 보호받습니다.
Abstract/초록/요약
During the last decades, the biological data (databases) have been growing exponentially. These biological data is classified by the biological research theme and each purpose of research is building in corresponding biological database. In order to analyze these interspecific biological data, this paper proposed the ReVAHD system. ReVA-HD is a graph-based visualization tool for the different bio-data types. In this paper, the ReVA-HD system uses four different biological databases. These databases are BLAST(sequence similarity database), COGs(orthologous gene database), DIP(protein-protein interaction database), and MMDB(protein 3D structure database). Relevant information from each of the systems is represented as graph using nodes and edges interaction. ReVA-HD which analyzing the interspecific bio-data types is the bioinformatics tool in terms of data mining. If more functions of biological data are found interspecific database analysis tools such as ReVA-HD will be used efficiently.
more목차
I 서론 1
II 관련 연구 3
III ReVA-HD 시스템 6
3.1 전체 시스템의 구조 6
3.2 그래프 기반의 데이터 표현 8
3.2.1 단백질 서열 정보의 그래프 표현 기법 8
3.2.2 계통발생적 분류 데이터를 이용한 그래프 표현 기법 9
3.2.3 단백질의 3차원 구조의 그래프 표현 기법 11
3.2.4 단백질-단백질 상호작용의 그래프 표현 기법 13
3.3 시스템 인터페이스 설계 16
IV 실험 및 연구 결과 20
V 결론 및 향후 연구과제 27
